思科肯定擔心微軟收購的Skype會對其利潤豐厚的視頻會議業務造成影響，因此它發布了一份由兩位世界級經濟學教授編寫的研究報告，提醒消費者注意象 Skype那樣的非標準軟件可能帶來的危害。加利福尼亞州伯克萊大學教授邁克爾卡茲（Michael Katz）和斯坦福大學經濟學家布萊恩凱庭（Bryan Keating）聲稱，政府應該介入進來并要求微軟整改，讓Skype能夠兼容其他的視頻產品。
思科警告說，否則Skype用戶就會得不到職業培訓和醫療保護。思科稱，微軟的Skype依賴于受專有權保護的標準，限制了Skype的6億用戶向非Skype用戶撥打電話的權利，而且讓企業也無法利用遠程會議的方式通過醫療服務系統和職業培訓系統與那些Skype用戶取得聯系。
思科的報告指出，微軟的Skype不支持思科產品所用的視頻和音頻標準。經濟學家們指出，思科也可以采取類似的策略，但思科并沒有在其新聞稿中引述經濟學家的那段話。
經濟學家們寫道：“象微軟那樣的公司追求的就是讓它的產品不能與其他公司的產品兼容。例如，Skype使用的協議都是無法與基于行業標準的視頻會議產品兼容的協議，企業用戶們也許會發現，要想與Skype的2億活躍用戶取得聯系，就必須使用微軟的視頻會議產品。”
思科總結卡茲和凱庭的意見稱，經濟學家們相信微軟將被迫使用通用標準，如果有必要的話，政府也可以介入進來。
專注于分析電信市場的研究公司Current Analytics的研究主管布萊恩里格斯（Brian Riggs）稱：“思科肯定有其打算，Skype對各種標準和互操作性都不友好。”
微軟可能很想讓Skype一直不兼容思科的產品，那樣它就可以賣出更多的Skype包月服務，面向企業通信軟件Lync的許可證。
但是思科的說法是不對的，實際上Skype可以與思科的網真系統協作，條件是企業客戶必須購買微軟的Skype Connect服務或第三方連接服務如Blue Jeans Network。
里格斯稱，思科沒有進行完全公平的對比，因為Skype是一款與思科產品完全不同的產品。
實際上，很多企業用戶會很樂意用其他的廉價解決方案如Skype來替代思科的產品。
這并非思科第一次與Skype交手。早在2010年的時候，思科高管托尼貝提思（Tony Bates）跳槽到Skype擔任首席執行官，之后他在2011年將公司賣給了微軟。
微軟宣布收購Skype的交易之后，思科曾向歐盟委員會提出訴訟，希望阻止微軟收購Skype，但它的計劃最終落空了。歐盟委員會無條件批準了那項收購交易。思科在2月份又向歐盟委員會提交了針對Skype的另一項起訴，現在那件案子還沒有結案。
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